在澳洲注册治疗呼吸机医疗器械的具体流程如下：

1. 确定产品分类：根据产品特性和用途，确定呼吸机医疗器械在澳大利亚医疗用品分类中的具体类别。

2. 准备注册资料：准备TGA注册所需的所有资料，包括产品技术规格、安全性能评估报告、临床试验报告等。

3. 提交注册申请：将所有资料提交给TGA进行注册申请。可以选择通过TGA的电子提交系统在线提交申请，或者通过邮寄方式提交纸质申请。

4. TGA审查：TGA将对提交的注册申请进行审查，以所提供的信息完整、准确并且符合相关标准和要求。审查过程可能包括对产品的测试和评估，以及对制造商的质量管理体系的审核。

5. 批准或拒绝：如果TGA认为申请符合要求，将授予医疗器械注册证书，并允许在澳大利亚市场上销售该产品。如果TGA认为申请不符合要求，将拒绝注册并告知制造商原因。

6. 跟踪更新：制造商需要定期更新注册信息，以与较新标准和要求保持一致。同时，TGA也会对已注册的医疗器械进行跟踪和监督，以产品的安全性和有效性。

需要注意的是，澳洲TGA对呼吸机医疗器械的注册要求非常严格，需要制造商具备相应的资质和经验，并且需要经过严格的测试和评估。因此，建议制造商在进行澳洲TGA呼吸机医疗器械注册前，充分了解相关法规和标准，并寻求的帮助和指导。