申请新加坡FDA注册的市场准入证书，可以按照以下步骤进行：

准备申请材料：申请方需要整理相关材料，包括产品相关文件、产品注册证明、技术说明书、性能测试报告等。这些材料应尽可能详细地描述产品的功能、设计和性能特征。

选择认证类别：根据核酸扩增检测分析仪的功能和用途，选择适用的认证类别。

编制申请文件：根据FDA的要求，申请方需要准备详细的申请文件，包括产品的技术规范、性能验证报告、临床试验报告等。在编制申请文件过程中，申请方需要保障文件的准确性和完整性。

提交申请文件：通过FDA的网站提交申请文件，并支付相关费用。一旦申请文件提交成功，FDA将进行初步审核。

FDA受理和预审：FDA将对申请的510(k)文件进行初步受理和预审。在此过程中，FDA可能会联系申请方以获取进一步的信息。

详细审查和反馈：FDA对510(k)文件进行详细审查。如果需要，FDA还会提供反馈意见，申请方需根据反馈进行相应的修改和完善。

获得市场准入证书：如果申请满足所有要求，FDA会颁发市场准入证书，允许产品在新加坡市场上销售和使用。

需要注意的是，申请市场准入证书的具体流程和要求可能因产品类型、用途和市场而有所不同。因此，建议在进行申请前，仔细了解新加坡FDA的相关规定和要求，以便更好地准备申请材料和符合相关标准。