等离子体治疗仪医疗器械注册需要按照以下步骤进行：

准备注册申请文件：根据国家监管部门的规定，准备充分的注册申请文件，包括技术文件、临床试验报告等。

提交注册申请：按照国家监管部门规定的申报流程，提交完整的注册申请。

审核和评估：监管部门将对注册申请文件进行审核和评估，包括技术文件、质量管理体系等。

临床试验（如需）：如果等离子体治疗仪需要进行临床试验，应按照相关规定进行临床试验，并提交临床试验资料。

审批：审核通过后，进行注册审批流程。

注册证书：如果注册申请获得批准，将获得医疗器械注册证书，允许该设备在市场上销售和使用。

后续管理：注册后，需要遵守监管部门的合规要求，进行质量体系考核、产品检测等后续管理。

以上步骤仅供参考，具体流程可能因国家或地区而异。建议与当地监管部门或人士咨询，以按照适用的规定正确地完成注册流程。