如果你的消融导管医疗器械在墨西哥注册过程中被认定为不合格，你可以采取以下措施：

1. 重新评估和改进产品：首先，你需要对产品进行重新评估，找出导致产品不合格的原因，并进行相应的改进。这可能涉及到产品设计、生产过程、质量控制等方面的调整。

2. 重新提交注册申请：在完成产品改进后，你可以重新向COFEPRIS提交注册申请。在新的申请中，你需要提供改进后的产品信息，以及证明产品已经达到注册标准的证据。

3. 配合COFEPRIS的调查：如果COFEPRIS对你的产品进行了现场检查或者产品质量抽查，你需要积极配合他们的工作，提供必要的信息和协助。

4. 召回已售出的产品：如果你的产品已经被销售到墨西哥市场，并且存在安全隐患或者不能达到预期的性能，你可能需要执行产品召回。

5. 赔偿消费者：如果你的产品给消费者造成了损失，你可能需要承担赔偿责任。

6. 接受xingzhengchufa：如果你的产品违反了墨西哥的医疗器械法规，COFEPRIS可能会对你进行罚款或者其他形式的xingzhengchufa。

以上只是一些基本的处理措施，具体的应对策略需要根据你的具体情况来制定。在任何情况下，你都应该寻求的法律和医学咨询，以你的行动符合墨西哥的法律法规，并且较大程度地保护消费者的权益和你自己的利益。