香港注册内窥镜细胞刷医疗器械的流程通常包括以下几个步骤：

1. 确定产品分类：首先需要确定内窥镜细胞刷产品属于哪一类医疗器械，这将决定后续的注册要求。

2. 准备注册文件：包括但不限于产品说明书、技术规格书、临床评价报告、生产质量管理体系文件、风险分析文件等。

3. 提交注册申请：将所有准备好的注册文件提交给香港卫生署的医疗器械注册处。

4. 文件审核：香港卫生署会对提交的文件进行审核，所有资料齐全且符合要求。

5. 现场核查：根据需要，香港卫生署可能会进行现场核查，以评估制造商的生产环境和质量管理体系。

6. 审核结果：审核通过后，香港卫生署会发放医疗器械注册证书。

7. 维持注册：注册证书发放后，制造商需要按照规定定期提交产品更新信息和不良事件报告，以维持注册状态。

请注意，以上流程可能会根据实际情况和香港卫生署的具体要求有所变化，建议在注册前咨询香港卫生署的指南或的医疗器械注册顾问。