是的，香港的医疗器械，包括碎石机，需要在香港卫生署进行注册。

根据香港法例第138章《医疗器械条例》及其附属条例，所有在香港销售、供应或为使用而进口的医疗器械均需注册。

注册流程包括提交详细的产品资料、技术文件和临床评价资料，以及证明产品符合安全、效能和质量标准的文件。

此外，供应商还需提供产品的预期用途、使用说明、可能的风险和预防措施等信息。未注册的医疗器械不得在香港销售或使用。