医疗器械手术控制系统临床试验样本量的确定是一个复杂的过程，它涉及多个因素。以下是一些影响样本量确定的主要因素：

1. 设计类型：样本量可能会受到试验设计类型的影响，如优效性试验、非劣效性试验或等效性试验。通常，优效性或非劣效性试验是单侧检验，而等效性试验是双侧检验。在同等条件下，双侧检验所需的样本量通常大于单侧检验。

2. 检验水准和检验效能：检验水准α通常设定为双侧0.05，单侧0.025。检验效能，即1-β，通常设定为不小于0.8。这些参数的选择会影响样本量的大小。

3. 界值的确定：界值，也称为容许误差，是指从临床意义角度可以判定差异的较小值。其确定通常基于统计学推断和临床意义。

4. 效应量：这反映了定量和定性资料的变异程度。效应量可以通过前期研究结果或文献报告进行估计，当没有相关资料时，则需要通过预试验获得。

5. 平衡或非平衡设计：平衡设计意味着每组样本量相同，这通常能在同等条件下提供较优的检验效能。然而，有时出于伦理考虑，可能会使用非平衡设计。

6. 样本量调整：考虑到临床试验中可能出现的脱落剔除情况，通常会对样本量进行相应的调整。通常，脱落剔除率不超过20%，但具体的剔除率应根据不同的研究项目来确定。

因此，医疗器械手术控制系统临床试验样本量的具体数值取决于上述多个因素的综合考虑。在实际操作中，建议咨询的医疗器械注册或律师事务所以获取具体的要求和指导。