在墨西哥，如果人工心肺机医疗器械注册不合格，需要进行销毁，可以按照以下步骤进行申请：

1. 提交申请：向COFEPRIS提交销毁申请，并提供不合格产品的详细信息，包括产品名称、型号、规格、批次等。

2. 填写表格：填写COFEPRIS要求的销毁申请表格，说明销毁的原因、数量、方式和时间等。

3. 审查：COFEPRIS将对销毁申请进行审查，销毁的原因和方式符合相关法规和规定。

4. 批准：如果COFEPRIS批准了销毁申请，可以按照批准的方式进行销毁。需要销毁过程的安全和环保，并将销毁记录提交给COFEPRIS备案。

5. 后续跟进：在销毁完成后，需要向COFEPRIS提供销毁证明和记录，并产品不再进入市场或再次使用。

需要注意的是，具体的销毁程序可能因产品特性和墨西哥的相关法规而有所不同。建议在提交销毁申请前与COFEPRIS或相关人士进行咨询，以的申请符合相关法规和规定。

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