治疗呼吸机医疗器械临床试验研究者的职责主要包括以下几个方面：

1. 试验设计和计划：研究者负责制定和规划呼吸机医疗器械临床试验。这包括确定试验的目的、研究问题、入选和排除标准、试验方案和统计分析计划[4]。

2. 伦理审查和批准：研究者负责向伦理委员会提交试验计划，并获得伦理审查批准。他们需要保障患者权益、试验的伦理合规性，并及时向委员会报告任何不良事件[4]。

3. 招募和筛选患者：研究者负责招募符合入选标准的患者，并进行患者的筛选过程。他们需要向患者详细解释试验的目的和程序，并患者提供知情同意[4]。

4. 试验执行：研究者监督试验的执行，试验按照预定的协议进行。他们需要对患者进行定期的监测，记录试验数据，数据的准确性和完整性[4]。

5. 不良事件监测和报告：研究者负责监测试验期间发生的任何不良事件，并按照规定及时报告给伦理委员会和监管，如FDA。这有助于试验的安全性[4]。

6. 数据分析和报告：一旦试验结束，研究者负责对试验数据进行分析，并撰写研究报告。这包括对呼吸机医疗器械的效果、安全性和可行性的全面评估[4]。

以上就是治疗呼吸机医疗器械临床试验研究者的主要职责。